發(fā)布時(shí)間:2021-10-29
10月28日,《自然-結(jié)構(gòu)和分子生物學(xué)》(Nature Structural & Molecular Biology)在線以長(zhǎng)文Article發(fā)表了劉興國(guó)組的最新成果 “Phase separation drives the self-assembly of mitochondrial nucleoids for transcriptional modulation”(相分離驅(qū)動(dòng)線粒體類核自組裝以進(jìn)行轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié))。該研究發(fā)現(xiàn)線粒體基因組與其結(jié)合蛋白,利用生物分子最基礎(chǔ)的自發(fā)聚集的相分離性質(zhì),調(diào)控線粒體類核的組裝以及轉(zhuǎn)錄的復(fù)雜過程,構(gòu)建了首個(gè)相分離調(diào)控線粒體基因組結(jié)構(gòu)與功能的模型。
相分離(Phase Separation,也稱相變)是生物大分子利用自身性質(zhì),自發(fā)聚集和組裝的過程和機(jī)制。大量的無(wú)膜細(xì)胞器通過相分離形成類細(xì)胞器結(jié)構(gòu),從而募集生物反應(yīng)組分,促進(jìn)和調(diào)控生物反應(yīng)的發(fā)生。更重要的是細(xì)胞核基因組的壓縮、染色質(zhì)區(qū)室化、和轉(zhuǎn)錄均受相分離的調(diào)控。線粒體是哺乳動(dòng)物細(xì)胞內(nèi)唯一具有自身遺傳物質(zhì)的細(xì)胞器。線粒體類核是線粒體基因組折疊并包裝形成的特殊亞細(xì)胞器結(jié)構(gòu): 環(huán)狀線粒體基因組,被線粒體“類組蛋白”— 線粒體轉(zhuǎn)錄因子 A (TFAM)折疊。然而一個(gè)基本科學(xué)問題是:線粒體基因組組裝與轉(zhuǎn)錄的空間秩序如何實(shí)現(xiàn)?
該研究發(fā)現(xiàn)線粒體轉(zhuǎn)錄因子 A (TFAM)可以通過相分離聚集;同時(shí)TFAM結(jié)合線粒體基因組后,共相分離形成形成液滴狀結(jié)構(gòu)。一個(gè)有趣的現(xiàn)象,與線狀DNA片段促進(jìn)液滴生不同,TFAM與線粒體環(huán)狀基因組所形成液滴大小均一,與體內(nèi)尺寸一致。
線粒體轉(zhuǎn)錄是一個(gè)多步驟、多復(fù)合物轉(zhuǎn)錄機(jī)器,包括轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物、轉(zhuǎn)錄延申復(fù)合物以及終止復(fù)合物等組裝接力的過程。劉興國(guó)團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)線粒體轉(zhuǎn)錄的各個(gè)復(fù)合物都能被TFAM-線粒體基因組通過特殊的多相相分離所招募,尤其是線粒體轉(zhuǎn)錄聚合酶POLRMT,被募集在類核相分離的外層,形成殼層結(jié)構(gòu),但并不能進(jìn)入TFAM-線粒體基因組的核心區(qū)球體。這種多相相分離既募集轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物,又控制轉(zhuǎn)錄進(jìn)入等待(standby)狀態(tài)。進(jìn)一步,在轉(zhuǎn)錄延申復(fù)合物的共相分離調(diào)控下,打破多相相分離壁壘,轉(zhuǎn)錄聚合酶POLRMT進(jìn)入核心區(qū)球體,組裝延申復(fù)合物,并進(jìn)行轉(zhuǎn)錄。最后通過另一重相分離募集轉(zhuǎn)錄終止復(fù)合物,終止或者抑制線粒體轉(zhuǎn)錄。
在線粒體長(zhǎng)期進(jìn)化中,線粒體基因組進(jìn)化出既不同于古細(xì)菌的單轉(zhuǎn)錄酶完成轉(zhuǎn)錄的簡(jiǎn)單方式,也不同于細(xì)胞核復(fù)雜調(diào)控的特殊路徑。雖然已有的研究解析了線粒體轉(zhuǎn)錄的多轉(zhuǎn)錄復(fù)合物結(jié)構(gòu),然而與線粒體組裝與轉(zhuǎn)錄機(jī)器匹配的模型一直尚待發(fā)現(xiàn)。本研究構(gòu)建了線粒體類核相分離調(diào)控組裝與轉(zhuǎn)錄的全新模型,通過“大道至簡(jiǎn)”而且保守的相分離的機(jī)制,串聯(lián)了線粒體類核組裝以及轉(zhuǎn)錄調(diào)控的各個(gè)過程。本發(fā)現(xiàn)是線粒體遺傳的中心法則的理論進(jìn)展,進(jìn)一步完善了線粒體遺傳信息的傳遞過程和機(jī)制,而且因?yàn)榫€粒體基因組在發(fā)育、衰老、遺傳、腫瘤等中的重要作用,本發(fā)現(xiàn)具有重要的生理病理意義。
所有真核生物的能量源泉來(lái)自線粒體基因組的組裝與功能,線粒體與細(xì)胞核在億萬(wàn)年進(jìn)化中“相遇相知相憐愛”,線粒體基因組以其半自主性,“半人半我半自在”,與細(xì)胞核相依存。“敢問呼吸源何處?為有卿卿相變來(lái)”,線粒體的核酸與細(xì)胞核的蛋白的相變?cè)忈屃撕粑础?/span>
本研究與清華大學(xué)、南方科技大學(xué)、北京大學(xué)、香港中文大學(xué)等合作完成的,獲得國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)項(xiàng)目、中科院、國(guó)家自然科學(xué)基金、廣東省和廣州市的經(jīng)費(fèi)支持。
線粒體類核自組裝及轉(zhuǎn)錄的多相相分離模型
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