發(fā)布時間:2020-10-13
10月8日,中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院秦寶明和Miguel A. Esteban課題組在Nature Communications雜志在線發(fā)表了題為“JMJD3 acts in tandem with KLF4 to facilitate reprogramming to pluripotency”的研究論文。
早前,團(tuán)隊(裴端卿、Miguel A. Esteban、王濤、秦寶明及其他成員)報道了維生素C(Vc)極大提高體細(xì)胞重編程效率,這一作用并非通過其經(jīng)典的抗氧化活性,而是來自其抑制細(xì)胞衰老以及促進(jìn)多能性相關(guān)基因的激活。根據(jù)以往有關(guān)Vc在干細(xì)胞以及細(xì)胞命運(yùn)轉(zhuǎn)變中的眾多零散發(fā)現(xiàn),研究人員推斷Vc的這些豐富的作用很可能來自其作為二價鐵的特異性還原劑,維持或激活一類二價鐵和a酮戊二酸依賴的雙加氧酶的活性,其中包括負(fù)責(zé)調(diào)控表觀遺傳的組蛋白和DNA去甲基化Jumonji家族和TET家族。后續(xù)團(tuán)隊是以Vc為有力工具,對這兩類重要的表觀遺傳調(diào)控酶家族開展了一系列探索,先后報道了JHDM1B、KDM3/4和TET1等對重編程的作用和機(jī)制,大大增進(jìn)了人們對甲基化修飾在細(xì)胞命運(yùn)維持和轉(zhuǎn)變中的作用和機(jī)制的認(rèn)知。同時,更多新的表觀遺傳機(jī)制在細(xì)胞命運(yùn)轉(zhuǎn)變中的機(jī)制有待發(fā)現(xiàn)。
作為個體發(fā)育和干細(xì)胞分化中最重要的組蛋白修飾之一,H3K27me3標(biāo)記發(fā)育分化基因并抑制其表達(dá),在基因組水平H3K27me3的動態(tài)變化是發(fā)育和分化得以有序進(jìn)行的重要基礎(chǔ)。體細(xì)胞重編程是發(fā)育和分化的逆向過程,H3K27me3勢必經(jīng)歷逆向的時空變化。此外,相當(dāng)一部分多能性以及上皮相關(guān)基因在初始成纖維細(xì)胞中都被H3K27me3修飾,這些基因的激活伴隨H3K27me3去甲基化。因此團(tuán)隊推斷,H3K27me3的去甲基化可能是重編程必需的限速環(huán)節(jié)。
在哺乳動物中,負(fù)責(zé)H3K27me3的去甲基化酶主要有UTX(即KDM6A)和JMJD3(即KDM6B),除了非常相似的去甲基化酶活性結(jié)構(gòu)域,兩者在結(jié)構(gòu)和功能都存在顯著差異。以往研究報道,UTX是重編程中眾多多能性相關(guān)基因激活所必需的,而JMJD3則通過2種途徑抑制重編程,即激活細(xì)胞衰老以及降解多能性相關(guān)因子PHF20。這2項研究都是在沒有Vc的條件下開展的,團(tuán)隊于是提出問題:在Vc條件下,JMJD3和UTX對重編程發(fā)揮怎樣的作用?
團(tuán)隊發(fā)現(xiàn),UTX與報道一致,而JMJD3對重編程則有2方面相反的作用。一方面,在傳代后期出現(xiàn)衰老特征的小鼠胚胎成纖維細(xì)胞(MEF)中,與以往報道一致,JMJD3通過激活I(lǐng)nk4a/Arf抑制重編程,而且這一效應(yīng)與重編程無關(guān);另一方面,在傳代早期年輕的MEF中,JMJD3提高重編程效率并且Vc能大大加強(qiáng)這一作用;在機(jī)制上,JMJD3被KLF4特異性地招募至上皮和多能性基因位點,并輔助KLF4激活這些基因。進(jìn)一步,團(tuán)隊還在多種其他KLF4介導(dǎo)的細(xì)胞命運(yùn)轉(zhuǎn)變中驗證了JMJD3的這一作用模式。因此,本研究對深入理解KLF4和JMJD3在相關(guān)發(fā)育、干細(xì)胞分化、生理和疾病條件下的復(fù)雜作用具有提示意義?!?nbsp;
本研究在秦寶明和Miguel A. Esteban兩位研究員共同指導(dǎo)下,由本院黃穎華博士和生物島實驗室張輝博士共同完成,并得到了來自南方科技大學(xué)Andrew P. Hutchins教授、吉林大學(xué)胡繼繁教授、本院裴端卿、陳捷凱、潘光錦、賴良學(xué)、鄭輝、鮑習(xí)琛等多位研究員、日本大阪大學(xué)Shizuo Akira教授、香港大學(xué)Ralf Jauch教授等眾多同事和國內(nèi)外同行的幫助和支持。在經(jīng)費(fèi)上,該工作得到了國家重點研發(fā)計劃、國家自然科學(xué)基金、生物島實驗室、中國科學(xué)院再生生物學(xué)重點實驗室、廣東省干細(xì)胞與再生醫(yī)學(xué)重點實驗室、廣東省和廣州市科技計劃等多個項目的支持。
廣州健康院揭示H3K27me3去甲基化酶JMJD3與KLF4在體細(xì)胞重編程中協(xié)同調(diào)控轉(zhuǎn)錄的新機(jī)制
附件下載: