l? 2018-至今??? ?中科院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院 研究員
l? 2016-2018?? ??UCB制藥/資深研究員
l? 2013-2016?? ??弗朗西斯克里克研究所/博士后 ?????
????????????????合作導(dǎo)師：John Diffley FRS? 英國皇家學(xué)會院士
l? 2012-2013?? ??癌癥研究所，倫敦大學(xué)/博士后?
????????????????合作導(dǎo)師：David Barford FRS 英國皇家學(xué)會院士????
l? 2008-2012??? ?癌癥研究所，倫敦大學(xué)/博士?????
????????????????指導(dǎo)導(dǎo)師：Edward Morris and David Barford
l? 2002-2006?? ??清華大學(xué)生物科學(xué)與技術(shù)系/學(xué)士?
????????????????指導(dǎo)導(dǎo)師:饒子和院士
真核生物染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能受到眾多表觀調(diào)控因子在時間與空間水平上的精準(zhǔn)調(diào)控，從而確保生命活動的有序進(jìn)行。DNA組蛋白和核小體的分子結(jié)構(gòu)與組成形式是造成染色質(zhì)動態(tài)結(jié)構(gòu)變化的基礎(chǔ)，并與其他表觀因子如組蛋白變體、組蛋白伴侶、組蛋白修飾酶和染色質(zhì)重塑復(fù)合物等一起調(diào)控染色質(zhì)的動態(tài)變化和功能。針對這一重要生命過程，課題組主要從以下幾個方向展開研究工作：
1. 重要表觀遺傳調(diào)控相關(guān)復(fù)合體的功能和分子機(jī)制
染色質(zhì)的表觀遺傳調(diào)控由相應(yīng)的大分子復(fù)合物來完成，想要充分闡明表觀遺傳信息是如何被呈現(xiàn)和維持的，就必須對這些調(diào)控復(fù)合物有分子水平上的理解。課題組通過生物化學(xué)和冷凍電鏡等手段，對乙?；头核鼗嚓P(guān)的表觀復(fù)合物開展功能和結(jié)構(gòu)研究，揭示其發(fā)揮生理功能的分子構(gòu)架特征。這些復(fù)合物往往與腫瘤等重要疾病發(fā)生密切相關(guān)，我們希望能進(jìn)一步在分子水平上理解其參與腫瘤發(fā)生發(fā)展的致病機(jī)理，并以此鑒定出創(chuàng)新性藥物靶標(biāo)蛋白。
2.染色質(zhì)動態(tài)的原位研究
常染色質(zhì)和異染色質(zhì)的動態(tài)變化是細(xì)胞命運(yùn)轉(zhuǎn)換的關(guān)鍵，但是這一變化的具體分子過程和調(diào)控機(jī)制還有很多未知之處。課題組致力于在細(xì)胞核內(nèi)原位環(huán)境中，在傳統(tǒng)細(xì)胞生物學(xué)研究的基礎(chǔ)上，結(jié)合轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組等組學(xué)手段和超分辨結(jié)構(gòu)光成像、冷凍電子斷層成像等成像手段，全面揭示多種表觀因子與染色質(zhì)的相互作用網(wǎng)絡(luò)，從而在多尺度上描繪這些表觀因子所主導(dǎo)的染色質(zhì)動態(tài)變化的分子景觀藍(lán)圖。
3. 基于人工智能的冷凍電鏡研究
課題組致力于通過AI算法的開發(fā)與應(yīng)用，一方面旨在提升Cryo-EM實(shí)驗(yàn)流程的自動化程度和數(shù)據(jù)收集效率；另一方面，則聚焦于對海量成像數(shù)據(jù)進(jìn)行深度挖掘與分析，以期揭示更為精細(xì)、全面的生物分子結(jié)構(gòu)與功能信息，從而為表觀遺傳調(diào)控及染色質(zhì)動態(tài)學(xué)的深入研究提供強(qiáng)有力的技術(shù)支持與數(shù)據(jù)洞察。
主要學(xué)術(shù)成果：
何俊博士，現(xiàn)任中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院研究員、博士生導(dǎo)師，入選中科院高層次人才項(xiàng)目，并兼任中國生物物理協(xié)會冷凍電子顯微學(xué)分會委員、中國電子顯微鏡學(xué)會廣東省分會委員。主要專注于利用冷凍電鏡等手段研究生物大分子的高分辨率三維結(jié)構(gòu)特征，探索在生理和病理過程中起到重要作用的表觀遺傳調(diào)控機(jī)器的結(jié)構(gòu)和分子機(jī)理。以第一作者和通訊作者身份在Cell Research、Molecular Cell、Nature Microbiology和 Nature Communication等國際高影響期刊上發(fā)表論文數(shù)十篇，多次受邀在國內(nèi)外會議上作學(xué)術(shù)報告。同時承擔(dān)國家重點(diǎn)研發(fā)計劃項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金國際(地區(qū))合作與交流項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金專項(xiàng)項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目、廣東省自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目等多個科研任務(wù)。
中國生物物理學(xué)會冷凍電子顯微學(xué)分會 委員
中國電子顯微鏡學(xué)會廣東省分會 委員中國生物物理學(xué)會冷凍電子顯微學(xué)分會 理事
2013 Chairman’s Prize for Best PhD, the Institute of Cancer Research
2012 Chinese Government Award for outstanding students abroad
1.Li, W. #, Cao, P. #, Xu, P., Sun, F., Wang, C., Zhang, J., Dong, S., Wilson, J. R., Xu, D., Fan, H., Feng, Z., Zhang, X., Zhu, Q., Fan, Y., Brown, N., Justin, N., Gamblin, S. J., Li, H., Zhang, Y.*, He, J*. Rapid reconstitution of ubiquitinated nucleosome using a non-denatured histone octamer ubiquitylation approach. Cell & Bioscience, 14(1), 81. (2024)
2.Zhang, J. #, Zhao, H., Zou, B., Li, H., Dong, S., Guan, J., Wang, C., Li, W., Liu, Y., Chen, Y., Rasheed, N.*, He, J*. Cryo-EM structure and functional analysis of the chromatin remodeler RSF. Acta Crystallographica Section F: Structural Biology Communications, 80: 125-34. (2024)
3.Xue, L. #, Chang, T. #, Li, Z., Wang, C., Zhao, H., Li, M., Tang, P., Wen, X., Yu, M., Wu, J., Bao, X., Wang, X., Gong, P., He, J., Chen, X.*, Xiong, X*. Cryo-EM structures of Thogoto virus polymerase reveal unique RNA 2 transcription and replication mechanisms among orthomyxoviruses. Nature Communications 15.1 : 4620. (2024)
4.Wang, N. #, Sheng, Y. #, Liu, Y., Guo, Y., He, J., Liu, J*. Cryo-EM structures of Mycobacterium tuberculosis polynucleotide phosphorylase suggest a potential mechanism for its RNA substrate degradation. Archives of Biochemistry and Biophysics, 754, 109917. (2024)
5.Liu, B. #, Niu, X. #, Deng, Y. #, Zhang, Z. #, Wang, Y., Gao, X., Liang, H., Li, Z., Wang, Q., Cheng, Y., Chen, Q., Huang, S., Pan, Y., Su, M., Lin, X., Niu, C., Chen, Y., Yang, W., Zhang, Y., Yan, Q., He, J., Zhao, J.*, Chen, L.*, Xiong, X*. An unconventional VH1-2 antibody tolerates escape mutations and shows an antigenic hotspot on SARS-CoV-2 spike. Cell reports, 43(6), 114265. (2024)
6. Dong, S. #, Li, H. #, Wang, M. #, Rasheed, N. #, Zou, B., Gao, X., Guan, J., Li, W., Zhang, J., Wang, C., Zhou, N., Shi, X., Li, M., Zhou, M., Huang, J., Li, H., Zhang, Y., Wong, K.H., Zhang, X., Chao, W.C.H.*, and He, J*. Structural basis of nucleosome deacetylation and DNA linker tightening by Rpd3S histone deacetylase complex. Cell Research 33, 790-801. (2023)
7. Zhang, X. #, Li, Z. #, Zhang, Y. #, Liu, Y. #, Wang, J., Liu, B., Chen, Q., Wang, Q., Fu, L., Wang, P., Zhong, X., Jin, L., Yan, Q., Chen, L., He, J.*, Zhao, J. *, and Xiong, X*. Disulfide stabilization reveals conserved dynamic features between SARS-CoV-1 and SARS-CoV-2 spikes. Life Science Alliance6. (2023)
8. Yu, H. #, Liu, B. #, Zhang, Y. #, Gao, X. #, Wang, Q. #, Xiang, H. #, Peng, X. #, Xie, C. #, Wang, Y. #, Hu, P., Shi, J., Shi, Q., Zheng, P., Feng, C., Tang, G., Liu, X., Guo, L., Lin, X., Li, J., Liu, C., Huang, Y., Yang, N., Chen, Q., Li, Z., Su, M., Yan, Q., Pei, R., Chen, X., Liu, L., Hu, F., Liang, D., Ke, B., Ke, C. *, Li, F. *, He, J. *, Wang, M.*, Chen, L.*, Xiong, X.*, and Tang, X*. Somatically hypermutated antibodies isolated from SARS-CoV-2 Delta infected patients cross-neutralize heterologous variants. Nature Communications 14, 1058. (2023)
9.Zhang, X.#, Xin, J.#, Wang, Z.#, Wu, W., Liu, Y., Min, Z., Xin, Y., Liu, B., He, J., Zhang, X., and Xu, X*. Structural basis of a bi-functional malonyl-CoA reductase (MCR) from the photosynthetic green non-sulfur bacterium Roseiflexus castenholzii. Mbio14, e0323322. (2023)
10. Tang, L. #, Dong, S. #, Rasheed, N. #, Wu, H.W. #, Zhou, N. #, Li, H., Wang, M., Zheng, J.*, He, J.*, and Chao, W.C.H*. Vibrio parahaemolyticus prey targeting requires autoproteolysis-triggered dimerization of the type VI secretion system effector RhsP. Cell Reports 41, 111732. (2022)
11. He, P. #, Liu, B. #, Gao, X. #, Yan, Q. #, Pei, R. #, Sun, J., Chen, Q., Hou, R., Li, Z., Zhang, Y., Zhao, J., Sun, H., Feng, B., Wang, Q., Yi, H., Hu, P., Li, P., Zhang, Y., Chen, Z., Niu, X., Zhong, X., Jin, L., Liu, X., Qu, K., Ciazynska, K.A., Carter, A.P., Briggs, J.A.G., Chen, J., Liu, J., Chen, X.*, He, J.*, Chen, L.*, and Xiong, X*. SARS-CoV-2 Delta and Omicron variants evade population antibody response by mutations in a single spike epitope. Nature Microbiology 7, 1635-1649. (2022)
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21. da Fonseca, P.C. #, He, J., and Morris, E.P*. Molecular model of the human 26S proteasome. Molecular cell 46, 54-66. (2012)
發(fā)明專利：
通過設(shè)計和改造二硫鍵交聯(lián)位點(diǎn)的SLC膜蛋白復(fù)合物的制備方法 何俊，官嘉麗，鄒彬倩 （專利號：ZL 2023 1 1158832.1）
軟件著作：
冷凍電鏡前期數(shù)據(jù)質(zhì)控軟件（cryoPurifier） （軟件著作登記號：2024SR0491806 ）
學(xué)生獲獎情況：
2021級
董淑琦（博士生） 榮獲中國科學(xué)院院長獎優(yōu)秀獎（2024年）、國家獎學(xué)金（2023年）、中國科學(xué)院大學(xué)優(yōu)秀畢業(yè)生（2024年）、北京市優(yōu)秀畢業(yè)生（2024年）、三好學(xué)生（2023年）、GIBH優(yōu)秀研究生獎學(xué)金一等獎（2024年）
2022級
官嘉麗（博士生）? 榮獲三好學(xué)生（2024年）、三等獎學(xué)金（2024年）
趙河豫（博士生）? 榮獲三好學(xué)生（2024年）
蘇小鳳（碩士生）? 榮獲三好學(xué)生（2024年）
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